روش های جانهی در داده های چند شکلی تک نوکلئوتیدی(snp) گم شده به صورت غیرتصادفی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی
- نویسنده محمود علیپورحیدری
- استاد راهنما حمید علوی مجد محمد رضا زالی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1390
چکیده
هنگامی که با داده های گم شده سر و کار داریم، توجه به مکانیزم گم شدن داده ها در استنباط آماری از اهمیت زیادی برخوردار است. کنار گذاشتن داده های گم شده به خصوص در شرایطی که مکانیزم گم شدن تصادفی نباشد، موجب مخدوش شدن نتایج تحلیل خواهد شد. در حال حاضر با استفاده از تحلیل های آماری، ارتباط بین چندریختی تک-نوکلئوتیدی (snp) با برخی از بیماری ها مورد توجه بسیاری از محققین می باشد. همچنین داده های snp گم شده، در مطالعات ارتباط سنجی ژنتیکی متداول است. لذا در این مطالعه، ارتباط بین snpهای موجود در ژن dnmt1 از کروموزوم 19 انسان را با بیماری سرطان روده بزرگ، مورد بررسی قرار دادیم. هدف از این مطالعه، ارایه روش جانهی در داده هایی با snpهای گم شده به صورت غیرتصادفی است. در این مطالعه مورد-شاهدی، از بین بیماران مراجعه کننده به مرکز تحقیقات بیماری های گوارش و کبد دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی تعداد یکصد بیمار مبتلا به بیماری سرطان روده بزرگ، به عنوان گروه مورد و یکصد نفر از سایر بیماران را به عنوان گروه شاهد تحت مطالعه قرار داده و آزمایشات ژنتیکی، جهت تعیین ژنوتیپ 6 مورد snp از ژن dnmt1 از کروموزوم 19 انسان، برای این بیماران انجام گردید. داده های حاصل با استفاده از روش رگرسیون لجستیک مورد تجزیه و تحلیل آماری قرار گرفت. سپس با حذف بخشی از داده ها به دو روش تصادفی و غیرتصادفی و جانهی آن ها با استفاده از الگوریتم em، تغییرات ضرایب رگرسیون لجستیک را قبل و بعد از این کار مقایسه نمودیم. یافته ها نشان داد که در هر دو روش گم شدن تصادفی و غیر تصادفی داده های snp، برآورد ضرایب رگرسیون لجستیک پس از جانهی توسط الگوریتم em، در مقایسه با روش حذف داده های گم شده، انطباق بیشتری با نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل داده های کامل دارند.
منابع مشابه
مقایسه روشهای مناسب جانهی مقادیر سانسور شده در داده های ژئوشیمیایی
در این تحقیق به بررسی روشهای جانهی مقادیر سانسور شده در مجموعه دادههای چند متغیره ژئوشیمیایی پرداخته شده است. وجود مقادیر گمشده باعث محدودیت در استفاده از اغلب روشهای آماری همچون تحلیل مولفههای اصلی میشود. حذف نمونههای شامل دادههای گمشده باعث اریب شدن نتایج و از دست دادن اطلاعات میشود به همین دلیل در نظر گرفتن رویکردی مناسب در مواجهه با دادههای گمشده یک نیاز اساسی در تحلیل مجموعه دا...
متن کاملجداسازی داده های خارج از رده به روش تک متغیره و چند متغیره در داده های ژئوشیمی محدوده طلای اپی ترمال ساری گونای
دادههای پرت در ژئوشیمی اکتشافی بسیار مهم هستند و میتوانند اثرات زیادی بر نتایج روشهای آماری از جمله جداسازی آنومالی از زمینه داشته باشند. بنابراین یکی از اولین مراحل پیش پردازش در تحلیل دادههای ژئوشیمیایی، تشخیص و تصمیمگیری در مورد حذف یا تصحیح آنها است. این دادهها را به 3 روش تک متغیره، دو متغیره و چند متغیره میتوان شناسایی کرد که هدف از این تحقیق جداسازی آنها با استفاده از روشهای تک...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملمقایسه روش های مناسب جانهی مقادیر سانسور شده در داده های ژئوشیمیایی
در این تحقیق به بررسی روشهای جانهی مقادیر سانسور شده در مجموعه دادههای چند متغیره ژئوشیمیایی پرداخته شده است. وجود مقادیر گمشده باعث محدودیت در استفاده از اغلب روشهای آماری همچون تحلیل مولفههای اصلی میشود. حذف نمونههای شامل دادههای گمشده باعث اریب شدن نتایج و از دست دادن اطلاعات میشود به همین دلیل در نظر گرفتن رویکردی مناسب در مواجهه با دادههای گمشده یک نیاز اساسی در تحلیل مجموعه دا...
متن کاملآزمون تعیین خطای مشخص سازی مدل خطی عام برای داده های گم شده
در این مقاله مدل خطی عام را در تحلیل دادههایی که در آنها متغیرهای کمکی و متغیر پاسخ گم شدگی دارند، در نظر می گیریم. برای تعیین نیکویی برازش مدل خطی عام در حضور دادههای گمشده، آزمون جدیدی را بر اساس آزمون رمزی(1969) می سازیم. نشان می دهیم که تحت فرض صفر، آماره های آزمون در برخی از حالات از توزیع فیشر تبعیت می کند و در برخی از حالات به توزیع شبهفیشر میل میکند. علاوه بر این، عملکرد آمارههای آ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023